いつもお世話になっております。
社会保険の控除について見直したいと思いお力をいただければと思います。

給与計算期間：１６日～翌月１５日　（例　2/16～3/15）
給与支給日：当月２５日　（例　3/25）
Ｈ29.10月までは　給与締日を２０日としておりましたが
給与計算の期間が短く計算が困難の為、Ｈ29.11月より１５日締めとしました
（例　給与計算期間：10/21～11/15→支給：11/25）

そこで今回、退職する社員について今月控除するべきなのか
悩んでいるところです。

入社日（資格取得日）：Ｈ27.9.7
給与締日（Ｈ27年当時）：20日
給与支給日：25日
第一回目の給与支給日の9月25日に社会保険料１ヶ月分を控除してるそうです。

↑のやり方の場合、当月徴収となっているのでしょうか。
Ｈ29.4.15付で退職した場合、4.25の給料から保険料は控除されるのでしょうか。
今まで担当している者も曖昧な感じでしたので
この際ハッキリさせたいと思っております。

社会保険の控除に関することや、給料の締日と関係があるのかを
教えていただきたいです。
どうぞよろしくお願い申し上げます。